直接RNA測(cè)序解鎖m6A，中國(guó)科學(xué)家揭示細(xì)胞命運(yùn)調(diào)控新機(jī)制
2025-01-23
外轉(zhuǎn)錄組修飾，尤其是N6-甲基腺苷（m6A），是基因表達(dá)的關(guān)鍵調(diào)控因子，影響著RNA的穩(wěn)定性、剪接和翻譯等過(guò)程。從Nanopore直接RNA測(cè)序（DRS）數(shù)據(jù)中檢測(cè)m6A的傳統(tǒng)計(jì)算方法受限于對(duì)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證標(biāo)簽的依賴，往往會(huì)導(dǎo)致對(duì)修飾位點(diǎn)的低估。在這項(xiàng)研究中，團(tuán)隊(duì)介紹了基于注意力的創(chuàng)新框架pum6a，它整合了正標(biāo)簽和非標(biāo)簽多實(shí)例學(xué)習(xí) (MIL)，以解決標(biāo)簽不完整和缺失讀碼級(jí)注釋的難題。
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